Mapping Gene Ontology

Cet outil permet de replacer des données (classiquement gènes ou protéines) associées à des identifiants GO (GO:xxxxxxx) sur l'arbre Gene Ontology.
Ceci permet de reclasser ces données par exemple en les regroupant dans des classes plus généralistes.
Les données soumises peuvent contenir d'autres notions de classification (comme up ou down regulated ou l'espèce, ...)

Le fichier d'entrée doit être un fichier texte tabulé
La première colonne doit contenir les données à classer (la liste de gènes par exemple).
Si le fichier contient d'autres données de classification, elles devront être incluses dans la seconde colonne.
La troisième colonne (ou la seconde s'il n'y a pas de données de classification) contient les GO. Cette colonne peut elle-même contenir des tabulations (en fait est considéré comme 2eme ou 3eme colonne (selon qu'il y ait une classification supplémentaire ou pas) toutes les colonnes suivantes).
Seuls les identifiants GO:xxxxxxx sont pris en compte. Peu importe qu'il y ait d'autres données associées (il n'est pas génant qu'il y ait des données Pfam ou l'annotation des GO ou tout autre texte).

En cas d'utilisation de la 2eme colonne comme colonne de classification, ne pas oublier de cocher la case "colonne de classification secondaire".

Si le fichier contient une première ligne d'entete (classiquement les titres des colonnes), ne pas oublier de cocher la case "Ne pas tenir compte de la première ligne".

Nom de l'analyse

Fichier à mapper

colonne de classification secondaire
Ne pas tenir compte de la première ligne.

mail : (un mail vous sera envoyé lorsque le traitement sera terminé, ainsi que le lien d'accès à vos données)

Contact : H. San Clemente